El equipo liderado por Zain Ul Abedien estudió el ganado bovino para comprender la diversidad microbiana en estados de salud y enfermedad.
La fundación Dairy Research de Australia premió a nueve científicos en el simposio denominado “Gardiner Foundation Emerging Scientist Competition”. Se valoraron investigaciones vinculadas con la biomasa de pasturas, la longevidad del ganado lechero y el estrés por calor en vacas. Fue premiado con el galardón de mejor abstract el candidato a PhD en la Universidad Tecnológica de Sydney, Zain Ul Abedien, que estudió el ganado bovino para comprender la diversidad microbiana en estados de salud y enfermedad.
Variaciones en el análisis
Abedien, junto con su equipo de trabajo, buscó explorar la diversidad microbiana y los patrones de expresión genética de diversos factores de virulencia y resistencia antimicrobiana en muestras rectales de terneros lecheros. El análisis se hizo en individuos con diferentes condiciones de salud y pertenecientes a cuatro grupos etarios (0-7, 8-14, 15-42 y más de 42 días de edad), muestreados de 72 establecimientos de Nueva Gales del Sur, Australia.
En total, se estudiaron 503 muestras rectales, incluidas 144 provenientes de animales con diarrea, mediante secuenciación de ARN de alto rendimiento. La taxonomía bacteriana se evaluó utilizando MetaPhlAn-4, calculando la diversidad alfa y beta.
Una descripción del paisaje microbiano
El panorama final fue el de un paisaje microbiano complejo, caracterizado por alrededor de 1000 géneros bacterianos distintos. Entre ellos se destacaron Anaerovibrio, Prevotella y Segatella. Los terneros sanos presentaron una diversidad microbiana mayor que aquellos animales sintomáticos.
Los análisis de expresión diferencial mostraron que, si bien los genes de resistencia antimicrobiana estuvieron presentes en todos los grupos etarios, se presentaron en abundancia en los casos de las crías con diarrea. Sin embargo, el resultado de las redes de correlación demostró algunas interacciones microbianas dependientes de la edad.
El estudio aporta potenciales objetivos para mejorar los diagnósticos. El uso de antimicrobianos y el desarrollo de estrategias de manejo pueden favorecer la salud de los terneros y reducir la carga de enfermedades en los rodeos lecheros.
